Teşvik sistemlerinde genellikle iki ödeme modeli bulunur:
Geri ödeme modeli: Firma hizmeti alır, ödemesini yapar ve daha sonra hibe tutarı iade edilir.
Proforma model: Hizmet alınmadan önce ön onayla beraber ödeme yapılır.
Hangi yöntemin geçerli olduğu başvurulan kuruma (KOSGEB, Ticaret Bakanlığı, TÜBİTAK vb.) göre değişiklik gösterebilir.